RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 FAM124AQ86V42 546 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTPRK-202ENST00000368205 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 C22orf46C9J442 243 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 MATN3O15232 486 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4F3Q08477 520 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 BORAQ6PGQ7 559 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-202ENST00000368205 FRS2Q8WU20 508 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 SYT3Q9BQG1 590 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 INVSQ9Y283 1065 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF20P17024 532 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-202ENST00000368205 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-202ENST00000368205 ZXDAP98168 799 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 LOXL4Q96JB6 756 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 C8orf49Q96NF6 230 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-202ENST00000368205 FPR2P25090 351 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 MCTP2Q6DN12 878 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 BTG4Q9NY30 223 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF28P17035 718 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 NKX3-2P78367 333 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM9Q13443 819 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 SURF1Q15526 300 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TESK1Q15569 626 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 CR1LQ2VPA4 569 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 STK32CQ86UX6 486 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP10Q86W26 655 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 CCDC103Q8IW40 242 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 DIO2Q92813 273 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ARNTLO00327 626 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 BCL6P41182 706 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 CHRNA2Q15822 529 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 CHST13Q8NET6 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 LAMTOR5O43504 91 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 LGR4Q9BXB1 951 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-202ENST00000368205 DTLQ9NZJ0 730 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF536O15090 1300 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 H7BY64 318 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 CPP00450 1065 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 EMC4Q5J8M3 183 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC140Q96MF4 163 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.65□□□□□ -1.34
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