RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFPP27918 469 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A11P48066 632 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF385BQ569K4 471 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QL4Q86Z23 238 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF4Q8WV16 495 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC14L1Q92503 715 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRC1Q96MC2 740 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC6Q99741 560 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF38Q9H0F5 515 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDND1Q9NY35 253 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 X6R8D5 127 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLACEA4D250 179 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASGR2P07307 311 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCAM1P13591 858 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBLN1P23142 703 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMLP29590 882 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPH6Q7L8W6 267 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBXN4Q92575 508 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKL1Q969V6 931 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MC3RP41968 323 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMS1P48059 325 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FZD5Q13467 585 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNA2Q15822 529 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTRK3Q16288 839 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 STYK1Q6J9G0 422 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM129CQ86XR2 697 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC7Q99615 494 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGSM2O43147 1006 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSCO60682 206 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKIO75912 1065 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM153BP0C7A2 387 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATF2P15336 505 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRK2P25098 689 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRK3P35626 688 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFE2L2Q16236 605 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIZQ2M2Z5 673 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM209AQ5JX71 171 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 LBX2Q6XYB7 198 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PANK1Q8TE04 598 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC2Q96KP1 924 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PALD1Q9ULE6 856 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR85P60893 370 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXO4P98177 505 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 STEAP3Q658P3 488 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PWWP2AQ96N64 755 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG1Q9BT22 464 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDIP1Q9H305 208 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASXL2Q76L83 1435 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRIT1O00522 736 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP7O14520 342 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAFKO60675 156 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNAT1P11488 350 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms