RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH7P12883 1935 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 RBL2Q08999 1139 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM210AQ96ND0 272 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 USP28Q96RU2 1077 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CALCRLQ16602 461 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC38Q5R3I4 469 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK8Q86SG6 692 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPYL6Q8N831 410 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 USP40Q9NVE5 1235 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DYDC2Q96IM9 177 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPRE2Q15555 327 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 POTEAQ6S8J7 498 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 HINFPQ9BQA5 517 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0232Q92628 1395 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA1P04083 346 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TBCCQ15814 346 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 USTQ9Y2C2 406 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 H0Y626 953 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM16O95361 564 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 LETM2Q2VYF4 491 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MEIS1O00470 390 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GABPAQ06546 454 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF653Q96CK0 615 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 C19orf60Q96EN9 201 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 RCN2Q14257 317 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CYTH1Q15438 398 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM50Q86XT4 487 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SIRT1Q96EB6 747 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PFKFB2O60825 505 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PICALMQ13492 652 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SPARCL1Q14515 664 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SCG2P13521 617 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 RFX1P22670 979 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 NLRP14Q86W24 1093 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DENND2AQ9ULE3 1009 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT75O95678 551 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ART3Q13508 389 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT81Q14533 505 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANXA13P27216 316 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 EPN3Q9H201 632 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DPH5Q9H2P9 285 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MSH2P43246 934 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM227BQ96M60 508 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO9A1A5B4 782 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GNGT2O14610 69 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GPC4O75487 556 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GGPS1O95749 300 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 POLKQ9UBT6 870 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM63Q969Q1 353 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 PALD1Q9ULE6 856 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 GCNT3O95395 438 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX1Q13596 522 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM1AO60341 852 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TESK2Q96S53 571 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF12Q16514 161 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-201ENST00000356331 FANCAO15360 1455 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms