RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KINO60870 393 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TDP2O95551 362 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TPM3P06753 285 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ALAS1P13196 640 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GJA5P36382 358 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 OAZ1P54368 228 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 POTEDQ86YR6 584 aa6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 H0YHG0 523 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SLC37A4O43826 429 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZNF202O95125 648 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 OR52Z1P0C646 297 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SREBF1P36956 1147 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SYKP43405 635 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B4P51659 736 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 USP11P51784 963 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MOGSQ13724 837 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TIGD1Q96MW7 591 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CHADLQ6NUI6 762 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RPAINQ86UA6 219 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CXorf38Q8TB03 319 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD62A6NC57 917 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 NFIBO00712 420 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ATP2A1O14983 1001 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CYP3A7P24462 503 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP4P98171 946 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GHRHRQ02643 423 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CALCRLQ16602 461 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 WDR78Q5VTH9 848 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 EPSTI1Q96J88 318 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MTMR9Q96QG7 549 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.82□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CTAGE5O15320 804 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CYP3A4P08684 503 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SNAPC2Q13487 334 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCR6-201ENST00000341935 USP49Q70CQ1 688 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MBOAT7Q96N66 472 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TKFCQ3LXA3 575 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 Q4G0T1 1027 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TSPY26PQ9H489 355 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RIPK3Q9Y572 518 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FSD2A1L4K1 749 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RNF146Q9NTX7 359 aa6.81□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 A0A087X0B3 334 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCR6-201ENST00000341935 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CCR6-201ENST00000341935 TXKP42681 527 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 LONRF3Q496Y0 759 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CST9Q5W186 159 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 MB21D1Q8N884 522 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 COL20A1Q9P218 1284 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 RPTORQ8N122 1335 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 CIITAP33076 1130 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 STAT3P40763 770 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 TECP42680 631 aa6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
CCR6-201ENST00000341935 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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