RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
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PTPRB-202ENST00000334414 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGEF5Q12774 1597 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRB-202ENST00000334414 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRB-202ENST00000334414 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRB-202ENST00000334414 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
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PTPRB-202ENST00000334414 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 ANXA13P27216 316 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 AP4S1Q9Y587 144 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 GMNCA6NCL1 334 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 LETM2Q2VYF4 491 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 APPBP2Q92624 585 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 H2AFVQ71UI9 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 EPC1Q9H2F5 836 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 HACD3Q9P035 362 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 SERPINB1P30740 379 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 AP3B1O00203 1094 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 MT-ND3P03897 115 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 MYCT1Q8N699 235 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 MBD2Q9UBB5 411 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 GOLGA8RI6L899 631 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 DTNBO60941 627 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 APOA4P06727 396 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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