RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 SMC2O95347 1197 aa22.62■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 REPS2Q8NFH8 660 aa22.62■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 SMARCE1Q969G3 411 aa22.62■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 PRR16Q569H4 304 aa22.61■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.61■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 POTEJP0CG39 1038 aa22.6■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.6■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.6■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 FAM86B1E9PN63 330 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 ATP2A1O14983 1001 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 SPATA20Q8TB22 786 aa22.59■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.59■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 RNF146Q9NTX7 359 aa22.59■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 DPYDQ12882 1025 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 LRMPQ12912 555 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 KRT79Q5XKE5 535 aa22.58■■□□□ 1.21
SUMO3-201ENST00000332859 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.58■■□□□ 1.21
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SUMO3-201ENST00000332859 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 FANCCQ00597 558 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 OPTNQ96CV9 577 aa22.57■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 SLC26A4O43511 780 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.57■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.57■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 COL20A1Q9P218 1284 aa22.57■■□□□ 1.2
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SUMO3-201ENST00000332859 UBXN2AP68543 259 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 GJA10Q969M2 543 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 PLIN2Q99541 437 aa22.56■■□□□ 1.2
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.56■■□□□ 1.2
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