RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 KLK7P49862 253 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 MAP3K12Q12852 859 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 DRP2Q13474 957 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RMND1Q9NWS8 449 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 A0A1W2PQC6 194 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 NCK2O43639 380 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 FAM228AQ86W67 206 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 LCORLQ8N3X6 602 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 NLRP3Q96P20 1036 aa20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TRIM37O94972 964 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 PAK2Q13177 524 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 WTAPQ15007 396 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 UBE3CQ15386 1083 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 MEA1Q16626 185 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 IQCKQ8N0W5 287 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 DNM2P50570 870 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 ODF2Q5BJF6 829 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 SAAL1Q96ER3 474 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 NAPBQ9H115 298 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 MYH7P12883 1935 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.03■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 GLI1P08151 1106 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 SLC8A1P32418 973 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 RPS6KA3P51812 740 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 ITIH3Q06033 890 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 MS4A14Q96JA4 679 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 EXOC1Q9NV70 894 aa20.02■□□□□ 0.8
PKP3-201ENST00000331563 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 KRT2P35908 639 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ZBED6P86452 979 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PTGDRQ13258 359 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 BATF3Q9NR55 127 aa20.02■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 DNM1LO00429 736 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 BACH1O14867 736 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PRDM1O75626 825 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 RREB1Q92766 1687 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 GMNCA6NCL1 334 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 WNT7AO00755 349 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 NUP58Q9BVL2 599 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 GGA2Q9UJY4 613 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.01■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 CYP7A1P22680 504 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 NFIXQ14938 502 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 C6orf89Q6UWU4 347 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 IFNL3Q8IZI9 196 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 LMBR1Q8WVP7 490 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 SH2D4AQ9H788 454 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PLAAQ9Y263 795 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 OPLAHO14841 1288 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 AKR1B10O60218 316 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 SPRED3Q2MJR0 410 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 CFAP221Q4G0U5 840 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 MSL1Q68DK7 614 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 MTRQ99707 1265 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ZNF263O14978 683 aa19.99■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 BMP15O95972 392 aa19.99■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
PKP3-201ENST00000331563 KCNB1Q14721 858 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms