RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 A6NNZ2 444 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAK2Q13177 524 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.64■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFAP4Q01664 338 aa24.64■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.64■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MECOMQ03112 1051 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAN2A1Q16706 1144 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDXDC1Q6P996 788 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUEDC2Q9H467 287 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR52Z1P0C646 297 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L8P0C7I0 530 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC41Q15345 812 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAG2Q9Y219 1238 aa24.63■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 E7EVH7 732 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 STXBP3O00186 592 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHHADHQ08426 723 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLAAQ9Y263 795 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L3A6NCW0 530 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L4A6NCW7 530 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRK1P26718 216 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNMA1Q12791 1236 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYMKA6NI61 221 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAD51CO43502 376 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLR2O60603 784 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRC1P26715 233 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRPHP41219 470 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEMA3FQ13275 785 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH1P12882 1939 aa24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARID5AQ03989 594 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 BARHL2Q9NY43 387 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1B0GUL6 1792 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQCDQ96DY2 449 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAD1O00515 517 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPROQ16827 1216 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD302Q8IX05 232 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MREGQ8N565 214 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 AK8Q96MA6 479 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 BACH1O14867 736 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDX5P30044 214 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMPD3Q01432 767 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXKP42681 527 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 EMC10Q5UCC4 262 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 SV2BQ7L1I2 683 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D5Q92609 795 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF1P21675 1872 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NTSR2O95665 410 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM107AO95990 144 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRB10Q13322 594 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRM4Q14833 912 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms