RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CLIC4Q9Y696 253 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 B4DLN1 442 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TBX3O15119 743 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 AOC2O75106 756 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 HSPA6P17066 643 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CRHR2Q13324 411 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 KCTD2Q14681 263 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NSMFQ6X4W1 530 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MORC4Q8TE76 937 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MMP19Q99542 508 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SPTLC2O15270 562 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MAFGO15525 162 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PTPREP23469 700 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 EDNRBP24530 442 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 C1QTNF8P60827 252 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GRB14Q14449 540 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PGM5Q15124 567 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 STK38Q15208 465 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 LETM2Q2VYF4 491 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FERMT2Q96AC1 680 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 RMDN3Q96TC7 470 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PORCNQ9H237 461 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQ27 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQ64 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PQD8 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NEMFO60524 1076 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PEX10O60683 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CCND2P30279 289 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ADALQ6DHV7 355 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GPR142Q7Z601 462 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PGBD1Q96JS3 809 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MTMR9Q96QG7 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 EFCC1Q9HA90 598 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CPA4Q9UI42 421 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MEIS1O00470 390 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 WNT7AO00755 349 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FIBPO43427 364 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CUTAO60888 179 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 HOXC6P09630 235 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 UBE2HP62256 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PTGDRQ13258 359 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 IRF5Q13568 498 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF174Q15697 407 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CEP55Q53EZ4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MORN1Q5T089 497 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 USP6NLQ92738 828 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 LENG9Q96B70 501 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FAM20AQ96MK3 541 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 RNF186Q9NXI6 227 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ASB14A6NK59 587 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TDP2O95551 362 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NR3C2P08235 984 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 OR52Z1P0C646 297 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MCM7P33993 719 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GRM1Q13255 1194 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PDIA5Q14554 519 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NFKBIBQ15653 356 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.68□□□□□ -1.34
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