RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299957.10

CASC4-201, Transcript of cancer susceptibility 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC4, Length 3,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4-201ENST00000299957 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 USTQ9Y2C2 406 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 STK36Q9NRP7 1315 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TRAPPC10P48553 1259 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 COG1Q8WTW3 980 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 KIFC2Q96AC6 838 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ATP8B1O43520 1251 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TROAPQ12815 778 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ALX1Q15699 326 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 MAN2A1Q16706 1144 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TCHPQ9BT92 498 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.63□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DIP2AQ14689 1571 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 KIF4AO95239 1232 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 GBP6Q6ZN66 633 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FLOT1O75955 427 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TNIP1Q15025 636 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 VWA3BQ502W6 1294 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ABCC12Q96J65 1359 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 APBA1Q02410 837 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.62□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 POTEB3A0JP26 581 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 POTECB2RU33 542 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 USP14P54578 494 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 PLTPP55058 493 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 POTEBQ6S5H4 581 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TECPR2O15040 1411 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 STAT1P42224 750 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 GUCY1A3Q02108 690 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 EHD4Q9H223 541 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 H2AFZP0C0S5 128 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 H2AFVQ71UI9 128 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.61□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 NF2P35240 595 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 NAA25Q14CX7 972 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RETREG2Q8NC44 543 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 USP32Q8NFA0 1604 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ACTN1P12814 892 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 MESDQ14696 234 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 TRIM9Q9C026 710 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 CALCOCO2Q13137 446 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 STIM2Q9P246 746 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.6□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 POTEFA5A3E0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
CASC4-201ENST00000299957 POTEIP0CG38 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms