RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 AK8Q96MA6 479 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 NFU1Q9UMS0 254 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 ABCA6Q8N139 1617 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PDCLQ13371 301 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 NDST4Q9H3R1 872 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CD19P15391 556 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 MAN1A1P33908 653 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 NLRP1Q9C000 1473 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 TAF11Q15544 211 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 RNF14Q9UBS8 474 aa20.35■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 GIPC1O14908 333 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 GTF2IP78347 998 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 GAS7O60861 476 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 GGCXP38435 758 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 LLGL1Q15334 1064 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CPXCR1Q8N123 301 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 DISC1Q9NRI5 854 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CHUKO15111 745 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 SEMA3EO15041 775 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB22O15209 634 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 ATF2P15336 505 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PLTPP55058 493 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.34■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 BTDP43251 543 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.33■□□□□ 0.85
PRKCI-201ENST00000295797 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 USP40Q9NVE5 1235 aa20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 STRN3Q13033 797 aa20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 SERPINB6P35237 376 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 BBOF1Q8ND07 529 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 DAPK3O43293 454 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 SCOCQ9UIL1 159 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 MYL1P05976 194 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 ADCY1Q08828 1119 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 MESDQ14696 234 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 LY9Q9HBG7 655 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 TTC36A6NLP5 189 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 PRCPP42785 496 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 POLE2P56282 527 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 DBN1Q16643 649 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 FBXO41Q8TF61 875 aa20.32■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 SYNE4Q8N205 404 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 PIGSQ96S52 555 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 CRB1P82279 1406 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 EMBQ6PCB8 327 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 USP17L8P0C7I0 530 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGAP4P98171 946 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 WHAMMQ8TF30 809 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 RAB20Q9NX57 234 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 LGALS16A8MUM7 142 aa20.31■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 SLCO1A2P46721 670 aa20.3■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 SLC8A3P57103 927 aa20.3■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 VSNL1P62760 191 aa20.3■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms