RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 CMA1P23946 247 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PDE6CP51160 858 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SNAP25P60880 206 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 DGKHQ86XP1 1220 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SHROOM2Q13796 1616 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 STAM2O75886 525 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PTPREP23469 700 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 GPSM2P81274 684 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ITIH3Q06033 890 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SEPT2Q15019 361 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 UBE2SQ16763 222 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ZNF827Q17R98 1081 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 LONRF3Q496Y0 759 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.08■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CCDC89Q8N998 374 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 KCNJ18B7U540 433 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 KCNJ12Q14500 433 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 COX16Q9P0S2 106 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 NT5C2P49902 561 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PPP2R5CQ13362 524 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RPS6KA1Q15418 735 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SMIM5Q71RC9 77 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ELF1P32519 619 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MORC3Q14149 939 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 AK8Q96MA6 479 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SNX25Q9H3E2 840 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PTCH1Q13635 1447 aa15.07■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 GAP43P17677 238 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 NLRP4Q96MN2 994 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RMDN3Q96TC7 470 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PSMB7Q99436 277 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 BRD1O95696 1058 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 IFNB1P01574 187 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MEIS1O00470 390 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RNF8O76064 485 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 STXBP2Q15833 593 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MTMR6Q9Y217 621 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 TXNDC9O14530 226 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CYP2D6P10635 497 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 IFNAR1P17181 557 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ITKQ08881 620 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PAK2Q13177 524 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 DCAF4Q8WV16 495 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 NT5C1BQ96P26 610 aa15.06■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 GNAT1P11488 350 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MTX1Q13505 466 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 MICALL2Q8IY33 904 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 ACCSQ96QU6 501 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 CUEDC2Q9H467 287 aa15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
USP22-201ENST00000261497 KIF11P52732 1056 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 PTK2Q05397 1052 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 PPFIA4O75335 1185 aa15.05■□□□□ -0
USP22-201ENST00000261497 SLC12A2P55011 1212 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms