RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 WHAMMQ8TF30 809 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GLG1Q92896 1179 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CABS1Q96KC9 395 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SCINQ9Y6U3 715 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 BMP3P12645 472 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CD19P15391 556 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CA8P35219 290 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KCTD2Q14681 263 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC24Q50LG9 513 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RPS6KA4O75676 772 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CAV1Q03135 178 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RESTQ13127 1097 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MYL10Q9BUA6 226 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 FEM1BQ9UK73 627 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PNMA3Q9UL41 463 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFA8P51970 172 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CUL1Q13616 776 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ELF2Q15723 593 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 VSIG1Q86XK7 387 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT3P12035 628 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NFKBIAP25963 317 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 STX2P32856 288 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RESP18Q5W5W9 173 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MASTLQ96GX5 879 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM232C9JQI7 657 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT15P19012 456 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GYG1P46976 350 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SEPT6Q14141 434 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINB2P05120 415 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 VSTM4Q8IW00 320 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 SULF1Q8IWU6 871 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 A6NJR5 290 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KRT19P08727 400 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 STAT2P52630 851 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 NECTIN1Q15223 517 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 MED10Q9BTT4 135 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 THEGQ9P2T0 379 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-201ENST00000261266 CRB1P82279 1406 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PHKA1P46020 1223 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 BFSP1Q12934 665 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 KRT71Q3SY84 523 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CLIC4Q9Y696 253 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ATP2C2O75185 946 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D8O95759 1140 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 IL9RQ01113 521 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 NR1H3Q13133 447 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC188H7C350 402 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 MYBL1P10243 752 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ALAS1P13196 640 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 GINM1Q9NU53 330 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ADCY8P40145 1251 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CYP2J2P51589 502 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 MECOMQ03112 1051 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 RASA3Q14644 834 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PCGF5Q86SE9 256 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TTC1Q99614 292 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 USP17L3A6NCW0 530 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 USP17L4A6NCW7 530 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms