RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 CPS1P31327 1500 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NDUFA10O95299 355 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D8O95759 1140 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G4BP0C869 781 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CCNE1P24864 410 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DDIT3P35638 169 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GNGT1P63211 74 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SESTD1Q86VW0 696 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ANO3Q9BYT9 981 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NDST4Q9H3R1 872 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NARFQ9UHQ1 456 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ABCA6Q8N139 1617 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 STAT3P40763 770 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC10P48553 1259 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CLCN6P51797 869 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TUBB4BP68371 445 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZNF394Q53GI3 561 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DGKHQ86XP1 1220 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 LRRC45Q96CN5 670 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CSADQ9Y600 493 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RICTORQ6R327 1708 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POTEB3A0JP26 581 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POTECB2RU33 542 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 DAPK3O43293 454 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FCER1AP12319 257 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MARK3P27448 753 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SLCO1A2P46721 670 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ANTXR2P58335 489 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 LIN9Q5TKA1 542 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RESP18Q5W5W9 173 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POTEBQ6S5H4 581 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CEP170P1Q96L14 293 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ATP10DQ9P241 1426 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB7AO95365 584 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CTDNEP1O95476 244 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 AKR1B1P15121 316 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 KLRK1P26718 216 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 INPP5BP32019 993 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 HSPA1LP34931 641 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 LIG3P49916 1009 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MAN2A1Q16706 1144 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MTERF2Q49AM1 385 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GALNT17Q6IS24 598 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 MADDQ8WXG6 1647 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POTEFA5A3E0 1075 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CSPG5O95196 566 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 POTEIP0CG38 1075 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 CHRNA5P30532 468 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 STAT2P52630 851 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 ITPK1Q13572 414 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 AOC3Q16853 763 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-201ENST00000261169 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms