RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PHF24Q9UPV7 400 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ESYT2A0FGR8 921 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TLK2Q86UE8 772 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C6Q969F1 213 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CCND2P30279 289 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ADCY7P51828 1080 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 KCNA10Q16322 511 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 AIFM3Q96NN9 605 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TMEM260Q9NX78 707 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD13C9JR72 458 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 BEX3Q00994 111 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 LY6KQ17RY6 165 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 DEXIO95424 95 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 TTLL4Q14679 1199 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 RABEP1Q15276 862 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 FERMT2Q96AC1 680 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 PGBD1Q96JS3 809 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ACLYP53396 1101 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SP2Q02086 613 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3FQ13275 785 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 GNASQ5JWF2 1037 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 STK36Q9NRP7 1315 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ASGR1P07306 291 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 NPY5RQ15761 445 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SPC25Q9HBM1 224 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQY0 241 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 STAM2O75886 525 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 CDKL5O76039 1030 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ICAM3P32942 547 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ANO3Q9BYT9 981 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 C6orf50Q9HD87 102 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP1Q07960 439 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SNX17Q15036 470 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 DPF3Q92784 378 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 A6NJR5 290 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 M0R2N6 131 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 JAK2O60674 1132 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ITGB5P18084 799 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 AP3B2Q13367 1082 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SYF2-201ENST00000236273 EDIL3O43854 480 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 TGFB3P10600 412 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GNA11P29992 359 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 GH1P01241 217 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 SREBF1P36956 1147 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms