RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.56■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.56■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 MYH7BA7E2Y1 1941 aa19.55■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL1O95922 423 aa19.55■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 HYAL1Q12794 435 aa19.55■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM192Q8IY95 271 aa19.55■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.55■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CHURC1Q8WUH1 139 aa19.55■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 STAG1Q8WVM7 1258 aa19.55■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 PRR23AA6NEV1 266 aa19.54■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 AMHP03971 560 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP4BP1P59074 171 aa19.54■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 KAT2BQ92831 832 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ASIC4Q96FT7 647 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 FSD1Q9BTV5 496 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.54■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CEP250Q9BV73 2442 aa19.54■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G6O60733 806 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC14Q08ET2 396 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 GMCL1Q96IK5 515 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPCS1-201ENST00000233025 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.53■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CD207Q9UJ71 328 aa19.53■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.53■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1671Q9BY89 1806 aa19.53■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 LOC730098B7Z3J9 87 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y858 1186 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ARIH2O95376 493 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 EDNRBP24530 442 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF618Q5T7W0 954 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TLR9Q9NR96 1032 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 PRR12Q9ULL5 1215 aa19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NFIBO00712 420 aa19.51■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A4P43007 532 aa19.51■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.51■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 YME1L1Q96TA2 773 aa19.51■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.5■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 TRPC6Q9Y210 931 aa19.5■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 EMSYQ7Z589 1322 aa19.5■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 MYO10Q9HD67 2058 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GSG1L2A8MUP6 293 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf67F2Z3F1 127 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00271P0C7V0 271 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 NBL1P41271 181 aa19.49■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 AFG1LQ8WV93 481 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TOP1MTQ969P6 601 aa19.49■□□□□ 0.71
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SPCS1-201ENST00000233025 GRM6O15303 877 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 RGS20O76081 388 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 MCCP23508 829 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PDE4DQ08499 809 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 CEP85Q6P2H3 762 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 SMRP1Q8NCR6 262 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 NEDD1Q8NHV4 660 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 ZFHX4Q86UP3 3567 aa19.47■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.47■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 CTNNB1P35222 781 aa19.47■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PDE4BQ07343 736 aa19.47■□□□□ 0.71
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM15Q13444 863 aa19.47■□□□□ 0.71
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