RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 MTRQ99707 1265 aa26.75■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.75■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.75■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.75■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 BMP6P22004 513 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 PPIL2Q13356 520 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 ISM2Q6H9L7 571 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 ELP3Q9H9T3 547 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 OTOFQ9HC10 1997 aa26.74■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 RLFQ13129 1914 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 POTEMA6NI47 508 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 GRB10Q13322 594 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 CEP55Q53EZ4 464 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 HS1BP3Q53T59 392 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 MB21D1Q8N884 522 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 ERMNQ8TAM6 284 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 MSH4O15457 936 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 KCNB1Q14721 858 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 RNF146Q9NTX7 359 aa26.72■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 MYL5Q02045 173 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 CUL4BQ13620 913 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 PNMA5Q96PV4 448 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 MEIS1O00470 390 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 BCRP11274 1271 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 PLCB2Q00722 1185 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 SV2BQ7L1I2 683 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 OTUD5Q96G74 571 aa26.71■■□□□ 1.87
RRP9-201ENST00000232888 IRF6O14896 467 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 STAMQ92783 540 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 WNK4Q96J92 1243 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 PLIN2Q99541 437 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.7■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 NCAPHQ15003 741 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 SLC5A5Q92911 643 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 COL20A1Q9P218 1284 aa26.69■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 AP5Z1O43299 807 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 STAT3P40763 770 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 FKBP1BP68106 108 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 LBX2Q6XYB7 198 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 RAD54LQ92698 747 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.68■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 CASP1P29466 404 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.862e-6■■■□□ 17
RRP9-201ENST00000232888 CHST13Q8NET6 341 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 LRRC15Q8TF66 581 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 TRIM9Q9C026 710 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 TRIM5Q9C035 493 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 ACAD9Q9H845 621 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 VAV3Q9UKW4 847 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 PTPRFP10586 1907 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 TREML2Q5T2D2 321 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 MOB2Q70IA6 237 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 RIT2Q99578 217 aa26.67■■□□□ 1.86
RRP9-201ENST00000232888 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms