RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229268.12

USP5-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP5, Length 3,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5-201ENST00000229268 RMND1Q9NWS8 449 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 HMGCS2P54868 508 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PSMC6P62333 389 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PLS1Q14651 629 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 DDX12PQ92771 950 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 WNK4Q96J92 1243 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.98□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 POLR2MP0CAP2 368 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 FOCADQ5VW36 1801 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 ZBTB39O15060 712 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 KLRC4O43908 158 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 ZNF18P17022 549 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CCZ1BP86790 482 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CEP135Q66GS9 1140 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 RNF181Q9P0P0 153 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 SIPA1L1O43166 1804 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 AMPD3Q01432 767 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 STIM1Q13586 685 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 VSTM4Q8IW00 320 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 SH2D4AQ9H788 454 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 ABCB11O95342 1321 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.97□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CENPFP49454 3210 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 SFI1A8K8P3 1242 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PSMA7O14818 248 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 MED24O75448 989 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 TNNT1P13805 278 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 KRT31Q15323 416 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 PICK1Q9NRD5 415 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 KCNJ18B7U540 433 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 FZD9O00144 591 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 UQCRHP07919 91 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 KCNJ12Q14500 433 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 TPH2Q8IWU9 490 aa14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP5-201ENST00000229268 MSH4O15457 936 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.026e-7■■■■□ 23.7
USP5-201ENST00000229268 GSDMDP57764 484 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 VPS33BQ9H267 617 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 SPON1Q9HCB6 807 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 SP4Q02446 784 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 UBXN1Q04323 297 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 GPBP1Q86WP2 473 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 ADSSL1Q8N142 457 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 RAD54LQ92698 747 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 DESI2Q9BSY9 194 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.95□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 VCAM1P19320 739 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 USP11P51784 963 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 ATG4CQ96DT6 458 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 SAMM50Q9Y512 469 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 EML1O00423 815 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 TBC1D12O60347 775 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.94□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 NRDCO43847 1150 aa14.93□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 PLA2G4BP0C869 781 aa14.93□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 ARP10275 920 aa14.93□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 RBL2Q08999 1139 aa14.93□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 AP3B2Q13367 1082 aa14.93□□□□□ -0.02
USP5-201ENST00000229268 PDIA5Q14554 519 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms