RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 FAM178BQ8IXR5 827 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 GLG1Q92896 1179 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MTBPQ96DY7 904 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 RIMBP2O15034 1052 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TMOD1P28289 359 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 STAT2P52630 851 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 PLTPP55058 493 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 GNPTABQ3T906 1256 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 63
TNS1-201ENST00000171887 TRPM2O94759 1503 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SCG2P13521 617 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HSPA6P17066 643 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ZMYND12Q9H0C1 365 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 PTPREP23469 700 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 STAMQ92783 540 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HOOK2Q96ED9 719 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 GCNT4Q9P109 453 aa10.01□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 H0Y3Z8 333 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SEC24BO95487 1268 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MESDQ14696 234 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ADALQ6DHV7 355 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HIPK4Q8NE63 616 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 H2AFZP0C0S5 128 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 H2AFVQ71UI9 128 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SUN2Q9UH99 717 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ITM2BQ9Y287 266 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 PARP3Q9Y6F1 533 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DNAJC6O75061 913 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ADCY2Q08462 1091 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MAGEF1Q9HAY2 307 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MAST3O60307 1309 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 RWDD2BP57060 319 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 CTDSPL2Q05D32 466 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 NLRX1Q86UT6 975 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 C8orf58Q8NAV2 365 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TRIM8Q9BZR9 551 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 UFL1O94874 794 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MORF4L2Q15014 288 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SNX14Q9Y5W7 946 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ADGRL1O94910 1474 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MYH3P11055 1940 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 A0A0G2JND7 137 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ACSL3O95573 720 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MAPK4P31152 587 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 NEK8Q86SG6 692 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ZFYVE19Q96K21 471 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 15.5
TNS1-201ENST00000171887 PLCH2O75038 1416 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ZBED4O75132 1171 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 IFNA8P32881 189 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 BLVRAP53004 296 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 FSCBQ5H9T9 825 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TAGAPQ8N103 731 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 YIPF3Q9GZM5 350 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 URB1O60287 2271 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MYO1FO00160 1098 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ENC1O14682 589 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 MID2Q9UJV3 735 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 TAC1P20366 129 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DEPDC1Q5TB30 811 aa10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.99□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 FBXW4P57775 412 aa9.99□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 BBS5Q8N3I7 341 aa9.99□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 STX19Q8N4C7 294 aa9.99□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 SPATA17Q96L03 361 aa9.99□□□□□ -0.81
TNS1-201ENST00000171887 NDE1Q9NXR1 346 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms