RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPRED2Q7Z698 418 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKS1AQ92625 1134 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LPXNO60711 386 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BAIAP3O94812 1187 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDHBP11177 359 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP2R5BQ15173 497 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PNMA1Q8ND90 353 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NFIBO00712 420 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC27A2O14975 620 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KPNA6O60684 536 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHMP4BP1P59074 171 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF543Q08ER8 600 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NECTIN1Q15223 517 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LCTP09848 1927 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERICH2A1L162 156 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LCHNA4D1U4 455 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNHG28P0DPA3 235 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CALML3P27482 149 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC16A2P36021 539 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE4DQ08499 809 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TET1Q8NFU7 2136 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCFD2Q8WU76 684 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A6NJR5 290 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEC23AQ15436 765 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF20Q5VTR2 975 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COPS5Q92905 334 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CD320Q9NPF0 282 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TANC1Q9C0D5 1861 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTGISQ16647 500 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHST3Q7LGC8 479 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WTAPQ15007 396 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAGE1Q8TC20 777 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEFB103AP81534 67 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SELPP16109 830 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANTXR2P58335 489 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EDNRBP24530 442 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCM5P33992 734 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJD3Q8N144 294 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RAD9AQ99638 391 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR33A8MZF0 331 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 B4DLN1 442 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRC1O43663 620 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 REC8O95072 547 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARIH2O95376 493 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNA5P22460 613 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERVK-21P61565 698 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPNMBQ14956 572 aa21.95■■□□□ 1.1
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