RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Senp1P59110 640 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tcp11Q01755 566 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Skap1Q3UUV5 355 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brip1Q5SXJ3 1174 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc9b1Q8C0X2 565 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf131Q8K3J5 619 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grin3bQ91ZU9 1003 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sar1bQ9CQC9 198 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lmod3E9QA62 571 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Esr2O08537 530 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lig1P37913 916 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AaasP58742 546 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Top1Q04750 767 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata18Q0P557 537 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsun7Q14AW5 724 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc5a5Q99PN0 618 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tjap1Q9DCD5 539 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp646Q6NV66 1788 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Btaf1E9QAE3 1848 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FosP01101 380 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EporP14753 507 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pth1rP41593 591 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Npr3P70180 536 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q66JV7 365 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr832Q7TRG9 312 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Skor1Q8BX46 964 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Havcr2Q8VIM0 281 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lonp2Q9DBN5 852 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klra17Q9JMA4 273 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r79E9Q067 851 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad51bO35719 350 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prl2c2P04095 224 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NeblQ0II04 452 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r209Q5NC97 312 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptger2Q62053 362 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Insm1Q63ZV0 521 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctnna3Q65CL1 895 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ms4a5Q810P8 197 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Depdc1aQ8CIG0 804 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces1Q8VCC2 565 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tex21Q9R0U9 575 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Meis2P97367 477 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd24Q80VM7 985 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phc3Q8CHP6 981 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plcg2Q8CIH5 1265 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm41Q8JZV4 413 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EpgnQ924X1 152 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif17Q99PW8 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samd1D3YXK1 519 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm1758F6VZZ1 202 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Orc4O88708 433 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5169Q5M8P2 212 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt14Q61781 484 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc7aQ8BGB2 858 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx19bQ8BZY3 494 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cog5Q8C0L8 829 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt222Q8CCX5 294 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgms1Q8VCQ6 419 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NapaQ9DB05 295 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfr2Q9JKX3 798 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Flvcr1B2RXV4 560 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SlmapQ3URD3 845 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rsad1Q5SUV1 442 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam196bQ6GQV1 535 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8C6G1 249 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekhg6Q8R0J1 787 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r218Q8R261 298 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chrna2Q91X60 512 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptf1aQ9QX98 324 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11983V9GXS8 105 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col1a1P11087 1453 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fgd3O88842 733 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Meis3P97368 378 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem232Q5K6N0 675 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc10a5Q5PT54 434 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Irak1Q62406 710 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oxnad1Q8VE38 311 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Saal1Q9D2C2 474 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc34Q3UI66 367 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms