RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm28919A0A087WP35 240 aa24.2■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa24.2■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Strip1Q8C079 837 aa24.2■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Setd4P58467 439 aa24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nlrx1Q3TL44 975 aa24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ErmardE9Q048 622 aa24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tesk2Q8VCT9 570 aa24.19■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nr1i3O35627 358 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim43aQ3TL54 445 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NntQ61941 1086 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Thap3Q8BJ25 218 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Men1O88559 611 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sept2P42208 361 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psd3Q2PFD7 1037 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf827Q505G8 1078 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh2b2Q9JID9 621 aa24.18■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stat4P42228 749 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rasa3Q60790 834 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Glra4Q61603 456 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mettl5Q8K1A0 209 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ParnQ8VDG3 624 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddah1Q9CWS0 285 aa24.17■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim6Q8BGE7 488 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Haus2Q9CQS9 234 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Flt1P35969 1333 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kifc2O08672 792 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rexo1Q7TT28 1213 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ubxn1Q922Y1 297 aa24.16■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd35E9Q9D8 996 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adam7O35227 789 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppfibp2O35711 882 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgd3O88842 733 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slurp2P0DP59 97 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tlr8P58682 1032 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd13cQ3UX43 541 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cog5Q8C0L8 829 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnajc17Q91WT4 303 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SyncQ9EPM5 470 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppfia4B8QI36 1187 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cct5P80316 541 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh3gl1Q62419 368 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh3gl2Q62420 352 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klhl20Q8VCK5 604 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc57Q9D1G5 239 aa24.15■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Akap2O54931 893 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif6O55135 245 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mx1P09922 631 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epb41l4aP52963 686 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm5169Q5M8P2 212 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb39Q6PDK0 712 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dpp8Q80YA7 892 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bbs7Q8K2G4 715 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem191cQ9JJB1 302 aa24.14■■□□□ 1.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Actn4P57780 912 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapk6Q61532 720 aa24.14■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa24.14■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nf2P46662 596 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 KhnynQ80U38 671 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cul5Q9D5V5 780 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ubr3Q5U430 1889 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ltbp1Q8CG19 1712 aa24.13■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm42641I6L9G2 585 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tom1O88746 492 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eef2P58252 858 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Senp1P59110 640 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sco1Q5SUC9 284 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stxbp3Q60770 592 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ggt6Q6PDE7 497 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AtripQ8BMG1 785 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nxnl2Q9D531 156 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il27raO70394 623 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wee1P47810 646 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vgll3P85442 326 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gas8Q60779 478 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp17leQ7M764 540 aa24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll1Q91V51 423 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms