RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	VOA1	P53262	265 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	COQ6	P53318	479 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	MAL12	P53341	584 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	ASI2	P53895	289 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	OCA2	P53949	197 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YAT1	P80235	687 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	CAB5	Q03941	241 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	RRG8	Q06109	277 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	GPN3	Q06543	272 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	LOT6	Q07923	191 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	BSC6	Q08280	497 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	MTR10	Q99189	972 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	DFG16	Q99234	619 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	JIP3	O13555	125 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YLR415C	O13578	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	CDC21	P06785	304 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	RAP1	P11938	827 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	CKA2	P19454	339 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	MGR1	P25573	417 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	RAD14	P28519	371 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	GSH1	P32477	678 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YBR144C	P34215	104 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YKL071W	P36086	256 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	ARA1	P38115	344 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	EFM2	P38347	419 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	MSS4	P38994	779 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	YJL206C	P39529	758 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	FMC1	P40491	155 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	SWP82	P43554	623 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	ABM1	P47146	123 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	TOM22	P49334	152 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	DIA3	P52290	468 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	SRL4	Q03085	281 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	WAR1	Q03631	944 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	URH1	Q04179	340 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	RXT3	Q07458	294 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	BTS1	Q12051	335 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	MED2	Q12124	431 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	GLE1	Q12315	538 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SLX8	YER116C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	SPE1	P08432	466 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ERG11	P10614	530 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	PMR1	P13586	950 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	CDC23	P16522	626 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	YPK2	P18961	677 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	VPS34	P22543	875 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	YCR015C	P25616	317 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	CYM1	P32898	989 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	YBR259W	P38338	688 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	SIC1	P38634	284 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	PET100	P38958	111 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	UBP5	P39944	805 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	GET2	P40056	285 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	UBX6	P47049	396 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	MSE1	P48525	536 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RMR1	P53060	241 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ROG1	P53118	685 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	SLT2	Q00772	484 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RPM2	Q02773	1202 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	MFM1	Q02783	413 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	MSC2	Q03455	724 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	BNA7	Q04066	261 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ARG7	Q04728	441 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ARR3	Q06598	404 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RTT109	Q07794	436 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	DSE3	Q08729	430 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	TGS1	Q12052	315 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	GET4	Q12125	312 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	VAM3	Q12241	283 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	PDE1	P22434	369 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	IMG1	P25626	169 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	ATP11	P32453	318 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	HIR2	P32480	875 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	EMP70	P32802	667 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SLX8	YER116C	AIM26	P32858	118 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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