RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	ARG81	P05085	880 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GPA1	P08539	472 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SAG1	P20840	650 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GEX1	P25596	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SRB4	P32569	687 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SUA5	P32579	426 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SLX1	P38324	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TMN3	P40071	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YIR014W	P40570	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YCL068C	P25593	260 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YIM1	P28625	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CEM1	P39525	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YGL185C	P53100	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SCW11	P53189	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	PIB2	P53191	635 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	SPC98	P53540	846 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	KTR6	P54070	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ARG7	Q04728	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	BMT6	Q12291	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MTR10	Q99189	972 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GAL3	P13045	520 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YSP3	P25036	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TAE1	P38340	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	TIM21	P53220	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	YGR079W	P53249	370 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	RTT102	P53330	157 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	GIS3	Q12418	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	YDR416W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FAR3	P46671	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YIP5	P53108	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DSL1	P53847	754 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PET117	Q02771	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MFM1	Q02783	413 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DCS1	Q06151	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YPR089W	O13585	888 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PDE2	P06776	526 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SEC62	P21825	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SDH8	P38345	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	END3	P39013	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PEX7	P39108	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YER085C	P40058	173 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MRK1	P50873	501 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DIA3	P52290	468 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BUD9	P53226	547 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SRL4	Q03085	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	VAC14	Q06708	880 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RTT109	Q07794	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
SYF1	YDR416W	BAG7	Q12128	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GSH1	P32477	678 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MSR1	P38714	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YGL114W	P53134	725 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SRN2	Q99176	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BCS1	P32839	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SWC5	P38326	303 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	UIP3	P39547	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YHC3	P47040	408 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BIO3	P50277	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MTL1	P53214	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FHN1	P53279	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	WAR1	Q03631	944 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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