RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 MMP14P50281 582 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 GUCY2DQ02846 1103 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 IQCA1Q86XH1 822 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 DDR1Q08345 913 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ABCF2Q9UG63 623 aa22.72■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 LRRC53A6NM62 1247 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 LCA5LO95447 670 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ERCC3P19447 782 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PAFAH1B1P43034 410 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PDE4DQ08499 809 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 NLRP14Q86W24 1093 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 MYH1P12882 1939 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 AKR1B10O60218 316 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 CALM1P0DP23 149 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 CALM2P0DP24 149 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 CALM3P0DP25 149 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 BLIDQ8IZY5 108 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 VCPKMTQ9H867 229 aa22.71■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 UBA7P41226 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SLC1A4P43007 532 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 RASSF7Q02833 373 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 IFT88Q13099 833 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 A6NNZ2 444 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 PLCG1P19174 1290 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 IFT20Q8IY31 132 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 FLT1P17948 1338 aa22.7■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA1P43355 309 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 RRAGAQ7L523 313 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.69■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 CCDC172P0C7W6 258 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 NUP98P52948 1817 aa22.68■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.68■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 PAK2Q13177 524 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 INF2Q27J81 1249 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 EMC10Q5UCC4 262 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.68■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 E7EVH7 732 aa22.67■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PMS1-222ENST00000639501 FTCDO95954 541 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CD302Q8IX05 232 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MREGQ8N565 214 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 MYL1P05976 194 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 VWA3BQ502W6 1294 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-222ENST00000639501 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.66■■□□□ 1.22
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