RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638160.1

CHML-205, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, human

TSL 3 BASIC

Gene CHML, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHML-205	ENST00000638160	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	ZEB2	O60315	1214 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	RXRA	P19793	462 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	GDF15	Q99988	308 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CHML-205	ENST00000638160	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	POLR2M	P0CAP2	368 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	BMP8B	P34820	402 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	STXBP2	Q15833	593 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	APOA5	Q6Q788	366 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	MICU3	Q86XE3	530 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PXMP2	Q9NR77	195 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	BEX3	Q00994	111 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TLE2	Q04725	743 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	CABYR	O75952	493 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PSMA5	P28066	241 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	FGD1	P98174	961 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PPP2R5B	Q15173	497 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TOX2	Q96NM4	488 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160		A0A1W2PPC1	479 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	ZBTB43	O43298	467 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	NR3C2	P08235	984 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TTLL4	Q14679	1199 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PTGS1	P23219	599 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	RCAN1	P53805	252 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	USP26	Q9BXU7	913 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		31.02	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		31.02	■■■□□ 2.56
CHML-205	ENST00000638160		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CPT1A	P50416	773 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	RTN1	Q16799	776 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	FBXL16	Q8N461	479 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	ARVCF	O00192	962 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CPA1	P15085	419 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CDK7	P50613	346 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160		Q6ZUG5	572 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		31	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CLTB	P09497	229 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	RPS6KB1	P23443	525 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CUL5	Q93034	780 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		30.98	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PIK3CD	O00329	1044 aa		30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	ARIH2	O95376	493 aa		30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PGM5	Q15124	567 aa		30.97	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160		A6NJR5	290 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	KPNA6	O60684	536 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	CCND2	P30279	289 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	FAAP100	Q0VG06	881 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	COPS5	Q92905	334 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	BRF1	Q92994	677 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CHML-205	ENST00000638160	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		30.96	■■■□□ 2.55

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