RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 NAT16Q8N8M0 369 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CDIP1Q9H305 208 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PRDM7Q9NQW5 492 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 GULP1Q9UBP9 304 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.1□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 ARVCFO00192 962 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 NEMP1O14524 444 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 FUCA1P04066 466 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PROCP04070 461 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 SOD2P04179 222 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CD8BP10966 210 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 FLT3P36888 993 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PAK1Q13153 545 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 LSAMPQ13449 338 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF111Q6ZNA4 994 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 THAP5Q7Z6K1 395 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 TEX2Q8IWB9 1127 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 PI4K2BQ8TCG2 481 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 JMJD8Q96S16 334 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 TMX1Q9H3N1 280 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 VTA1Q9NP79 307 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CLDND1Q9NY35 253 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 CBLCQ9ULV8 474 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SPTAN1-232ENST00000636483 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC66A2RUB6 948 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CBX4O00257 560 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 MSTNO14793 375 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 GSC2O15499 205 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 DYRK3O43781 588 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 F2P00734 622 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE6AP16499 860 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 KRT15P19012 456 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 FPR2P25090 351 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 GALK1P51570 392 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CLCN7P51798 805 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 JAM2P57087 298 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ST5P78524 1137 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TMPRSS15P98073 1019 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PRKCQQ04759 706 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ZP2Q05996 745 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ITKQ08881 620 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 IKZF1Q13422 519 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 MTMR1Q13613 665 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 STAT4Q14765 748 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TESK1Q15569 626 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 COG1Q8WTW3 980 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ASB11Q8WXH4 323 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 USP7Q93009 1102 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXW5Q969U6 566 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 HHIPL1Q96JK4 782 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ALG1Q9BT22 464 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 C19orf44Q9H6X5 657 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTLC3Q9NUV7 552 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 MARCH2Q9P0N8 246 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 MCM8Q9UJA3 840 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 VAV3Q9UKW4 847 aa3.08□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.07□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms