RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628757.2

PCBP1-AS1-333, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 623 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RAD9A	Q99638	391 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PRR33	A8MZF0	331 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SELP	P16109	830 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GJD3	Q8N144	294 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MAF1	Q9H063	256 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757		M0R2C6	588 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GH1	P01241	217 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DGKD	Q16760	1214 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SLC16A2	P36021	539 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	STXBP2	Q15833	593 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KRT40	Q6A162	431 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SAMD11	Q96NU1	681 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KCNH6	Q9H252	994 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NFIB	O00712	420 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GJB5	O95377	273 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	AMH	P03971	560 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KCNA5	P22460	613 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PTGS1	P23219	599 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ERVK-21	P61565	698 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TTC14	Q96N46	770 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NCK2	O43639	380 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ORC4	O43929	436 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	NMT2	O60551	498 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PTK7	Q13308	1070 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SESTD1	Q86VW0	696 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	VWCE	Q96DN2	955 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LPXN	O60711	386 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	MMP3	P08254	477 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	CKB	P12277	381 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	USH1G	Q495M9	461 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	COPS5	Q92905	334 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-333	ENST00000628757	LCT	P09848	1927 aa		11.54	□□□□□ -0.56

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