RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TKFCQ3LXA3 575 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MB21D1Q8N884 522 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD1Q96MW7 591 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF146Q9NTX7 359 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CIITAP33076 1130 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 STAT3P40763 770 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCRLQ16602 461 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EPSTI1Q96J88 318 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 COL20A1Q9P218 1284 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE5O15320 804 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2A2P52657 109 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 HERVK_113P62684 666 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPP22059 807 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 Q4G0T1 1027 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 MAF1Q9H063 256 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD7Q9P203 1132 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CETPP11597 493 aa28.18■■■□□ 2.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 SPRYD7Q5W111 196 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS2L3Q86XJ1 694 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RPTORQ8N122 1335 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PLS1Q14651 629 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 HAS1Q92839 578 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 AK8Q96MA6 479 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PASKQ96RG2 1323 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM86B1E9PN63 330 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TXKP42681 527 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.15e-6■■□□□ 12.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF22Q8N9C0 903 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 LENG9Q96B70 501 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SDF4Q9BRK5 362 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAD9Q9H845 621 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CNMDO75829 334 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 NSMFQ6X4W1 530 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 KRBA2Q6ZNG9 492 aa28.15■■■□□ 2.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHST13Q8NET6 341 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087X0B3 334 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TECP42680 631 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL15Q16663 113 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 PANK2Q9BZ23 570 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF3CO14782 793 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX3O15119 743 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF76P36508 570 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN2AP68543 259 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRR16Q569H4 304 aa28.13■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 CCSER1Q9C0I3 900 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 FSD2A1L4K1 749 aa28.13■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDIA5Q14554 519 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 PNMA3Q9UL41 463 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 PP2D1A8MPX8 630 aa28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 SERTAD1Q9UHV2 236 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD19C9JJ37 291 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB34Q9BZG1 259 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP39A1Q9NYL5 469 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO40Q9UH90 709 aa28.11■■■□□ 2.09
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