RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.75□□□□□ -0.85
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SGMS1-211ENST00000626236 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 PXMP2Q9NR77 195 aa9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 GABRQQ9UN88 632 aa9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.72□□□□□ -0.85
SGMS1-211ENST00000626236 BRD1O95696 1058 aa9.71□□□□□ -0.86
SGMS1-211ENST00000626236 F13A1P00488 732 aa9.71□□□□□ -0.86
SGMS1-211ENST00000626236 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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