RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP2R5BQ15173 497 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC62Q6P9F0 684 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 OR6J1Q8NGC5 347 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 COPS5Q92905 334 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 RMDN3Q96TC7 470 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.39■■□□□ 1.98
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC27A2O14975 620 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 ARIH2O95376 493 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CFBP00751 764 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TXNP10599 105 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CPT1AP50416 773 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PURAQ00577 322 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 NECTIN1Q15223 517 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PIGSQ96S52 555 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MTA3Q9BTC8 594 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.38■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 A6NJR5 290 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TTLL4Q14679 1199 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 STXBP2Q15833 593 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 LY9Q9HBG7 655 aa27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K14Q99558 947 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.36■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PRC1O43663 620 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 NR3C2P08235 984 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MYL3P08590 195 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 SEPT14Q6ZU15 432 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 HOMER1Q86YM7 354 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PXMP2Q9NR77 195 aa27.35■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 B4GALT4O60513 344 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MCM5P33992 734 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TRAF1Q13077 416 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa27.34■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 KPNA6O60684 536 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CSF2RAP15509 400 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2C18P33260 490 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 LY6KQ17RY6 165 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 CASC1Q6TDU7 716 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TMTC2Q8N394 836 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM199Q8N511 208 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.33■■□□□ 1.97
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM87BQ96K49 555 aa27.32■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.963e-13■■■■□ 24.3
PPP1CC-211ENST00000620030 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 DDAH1O94760 285 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 SMARCA1P28370 1054 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGAP1Q07960 439 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM240Q5SV17 173 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 MYL10Q9BUA6 226 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 HIPK3Q9H422 1215 aa27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 MYH6P13533 1939 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 GH1P01241 217 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 VSIG10LQ86VR7 867 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.3■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 RGS20O76081 388 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR2MP0CAP2 368 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 LIFRP42702 1097 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 AFG1LQ8WV93 481 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 ACRP10323 421 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF5BP33176 963 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 RASIP1Q5U651 963 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 IL23AQ9NPF7 189 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.27■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 PGM5Q15124 567 aa27.27■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.27■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.27■■□□□ 1.96
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF365Q70YC5 407 aa27.27■■□□□ 1.96
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