RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614198.4

GGA3-221, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 3,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-221	ENST00000614198	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	GPC2	Q8N158	579 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DPF2	Q92785	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	HTT	P42858	3142 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CTAGE5	O15320	804 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	XBP1	P17861	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	LMAN1	P49257	510 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	UBXN2A	P68543	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	MKL1	Q969V6	931 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	MTMR2	Q13614	643 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CCP110	O43303	1012 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ZNF202	O95125	648 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	BMP3	P12645	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	SPP2	Q13103	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	YEATS4	O95619	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	GNAQ	P50148	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TDP2	O95551	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TNNI2	P48788	182 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PNOC	Q13519	176 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ZBTB5	O15062	677 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	OPLAH	O14841	1288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	SLC37A4	O43826	429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	COBL	O75128	1261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	POTED	Q86YR6	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-221	ENST00000614198	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-221	ENST00000614198	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.15	□□□□□ -0.63

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