RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 BMP3P12645 472 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 SMPD1P17405 629 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 KCNJ6P48051 423 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CPT1AP50416 773 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CNTN2Q02246 1040 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 GRB10Q13322 594 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 ESR2Q92731 530 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR7Q9Y216 660 aa22.53■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 MCCP23508 829 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 PSMC6P62333 389 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 BFSP2Q13515 415 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
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SGMS1-208ENST00000608287 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.52■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 EPOPA6NHQ4 379 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 SGSM2O43147 1006 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 SLC1A4P43007 532 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 NOVP48745 357 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 MRE11P49959 708 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 STAT2P52630 851 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 FAM160B2Q86V87 743 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 GJD3Q8N144 294 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 GMCL1Q96IK5 515 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 RNF146Q9NTX7 359 aa22.51■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 REV3LO60673 3130 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM232C9JQI7 657 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 PTH1RQ03431 593 aa22.5■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 KRT40Q6A162 431 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 VWCEQ96DN2 955 aa22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 SCN5AQ14524 2016 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 B4E1Z4 1266 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 CYP2C9P11712 490 aa22.49■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.194e-7■■□□□ 11.7
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SGMS1-208ENST00000608287 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF536O15090 1300 aa22.49■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.48■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 KDM4AO75164 1064 aa22.48■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 UIMC1Q96RL1 719 aa22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 NOD1Q9Y239 953 aa22.48■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 NT5C2P49902 561 aa22.47■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 IQCA1Q86XH1 822 aa22.47■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC14Q96N46 770 aa22.47■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.47■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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SGMS1-208ENST00000608287 SNX27Q96L92 541 aa22.46■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 FAM50BQ9Y247 325 aa22.46■■□□□ 1.19
SGMS1-208ENST00000608287 MYL3P08590 195 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ALAS1P13196 640 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 CAGE1Q8TC20 777 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 MORC4Q8TE76 937 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.45■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PLA2G6O60733 806 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 EFCAB14O75071 495 aa22.44■■□□□ 1.18
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