RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCM6Q14566 821 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIPA1L1O43166 1804 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASQ1P31415 396 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNM2P50570 870 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNG11P61952 73 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AP3B2Q13367 1082 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HAS1Q92839 578 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DESI2Q9BSY9 194 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMNQ9BXJ7 453 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYMKA6NI61 221 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC26A4O43511 780 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GDF11O95390 407 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C21orf2O43822 256 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FCER1AP12319 257 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTF1Q14872 753 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSRNP1Q96S65 589 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 YDJCA8MPS7 323 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L15C9J2P7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L11C9JVI0 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L18D6R9N7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L22D6RA61 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L19D6RCP7 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L20D6RJB6 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFB10O96000 172 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP3A7P24462 503 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L24Q0WX57 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMD2Q13200 908 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANO3Q9BYT9 981 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GH2P01242 217 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT9P35527 623 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXO11Q86XK2 927 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BMP3P12645 472 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CENPPQ6IPU0 288 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HYIQ5T013 277 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTLL6Q8N841 843 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MBOAT7Q96N66 472 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP58Q9BVL2 599 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DYMQ7RTS9 669 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX12PQ92771 950 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MEIS2O14770 477 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAF1Q13077 416 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RETREG2Q8NC44 543 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF5CO60282 957 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPDYE6P0CI01 402 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IDEP14735 1019 aa20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms