RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	ALX1	Q15699	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	PTGIS	Q16647	500 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	TTC14	Q96N46	770 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HKR1-222	ENST00000591417	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	LCT	P09848	1927 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	FGR	P09769	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MX1	P20591	662 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MAF1	Q9H063	256 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EFCAB14	O75071	495 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EDNRB	P24530	442 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	GRB10	Q13322	594 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	COPS5	Q92905	334 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	GH1	P01241	217 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	PDHB	P11177	359 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	SELP	P16109	830 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	KRT40	Q6A162	431 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TRANK1	O15050	2925 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	FGA	P02671	866 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	IKBKE	Q14164	716 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	STXBP2	Q15833	593 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	DGKD	Q16760	1214 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	RAD9A	Q99638	391 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	FOXP2	O15409	715 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	GPR37L1	O60883	481 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MMP3	P08254	477 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	USH1G	Q495M9	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ABCB11	O95342	1321 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	LPXN	O60711	386 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ARIH2	O95376	493 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	NT5C2	P49902	561 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ERVK-21	P61565	698 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	ESR2	Q92731	530 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HKR1-222	ENST00000591417	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28

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