RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590599.1

CTDP1-205, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 1,762 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-205ENST00000590599 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TIGD1Q96MW7 591 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TSPY26PQ9H489 355 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 FSD2A1L4K1 749 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SREBF1P36956 1147 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 OAZ1P54368 228 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 FKBP1BP68106 108 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 ARHGAP4P98171 946 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TREML2Q5T2D2 321 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 WNK4Q96J92 1243 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SLC37A4O43826 429 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 EDIL3O43854 480 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 NOGQ13253 232 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 USP49Q70CQ1 688 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TBC1D5Q92609 795 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 EPSTI1Q96J88 318 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TXLNAP40222 546 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 REPS2Q8NFH8 660 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.49■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 NFIBO00712 420 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC192P0DO97 292 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HSD17B4P51659 736 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC102AQ96A19 550 aa20.48■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 PDILTQ8N807 584 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CNNM3Q8NE01 707 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MTMR9Q96QG7 549 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MARCH6O60337 910 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CYP3A7P24462 503 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 LONRF3Q496Y0 759 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 AK8Q96MA6 479 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 PANK2Q9BZ23 570 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 RNF146Q9NTX7 359 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 ATP2A1O14983 1001 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TXKP42681 527 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 GHRHRQ02643 423 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SNAPC2Q13487 334 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-205ENST00000590599 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 CYP3A4P08684 503 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 ZNF76P36508 570 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 DHX58Q96C10 678 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 MBOAT7Q96N66 472 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 RAB34Q9BZG1 259 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 UBA7P41226 1012 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 TECP42680 631 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 MRE11P49959 708 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 TYRO3Q06418 890 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 PLS1Q14651 629 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 TKFCQ3LXA3 575 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 MB21D1Q8N884 522 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 CIITAP33076 1130 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 GJA5P36382 358 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 Q4G0T1 1027 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 PRR16Q569H4 304 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 KANK3Q6NY19 840 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-205ENST00000590599 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms