RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587303.5

PTPRS-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 6,353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-204ENST00000587303 RNF181Q9P0P0 153 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 TSKSQ9UJT2 592 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ADALQ6DHV7 355 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 DENND2CQ68D51 928 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 COA7Q96BR5 231 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PDE8BO95263 885 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 RFX6Q8HWS3 928 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ZMYM6O95789 1325 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MYL7Q01449 175 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ELMOD1Q8N336 334 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CDHR1Q96JP9 859 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 KCNJ18B7U540 433 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 KCNJ12Q14500 433 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ADORA1P30542 326 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PTK2Q05397 1052 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MED23Q9ULK4 1368 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 KRT3P12035 628 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 BFSP1Q12934 665 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 HOXD10P28358 340 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MORC3Q14149 939 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CROCCP2Q86T23 111 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 RNF139Q8WU17 664 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 RAB17Q9H0T7 212 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 DPYSL4O14531 572 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 INPP5BP32019 993 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PTPN21Q16825 1174 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 IL17REQ8NFR9 667 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MASTLQ96GX5 879 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ZNF233A6NK53 670 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 OPHN1O60890 802 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PGBD1Q96JS3 809 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 CCNYQ8ND76 341 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 BUB1O43683 1085 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 EPHB1P54762 984 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 MFAP3P55082 362 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ZNF827Q17R98 1081 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 ADAMTS12P58397 1594 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-204ENST00000587303 KCNK3O14649 394 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 CLIC6Q96NY7 704 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 WDR64B1ANS9 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 MYO1EQ12965 1108 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 PAK2Q13177 524 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 NT5C1BQ96P26 610 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 ITM2BQ9Y287 266 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 FGAP02671 866 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 MORC4Q8TE76 937 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 TTC1Q99614 292 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 STX2P32856 288 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 IQCB1Q15051 598 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 RAPH1Q70E73 1250 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-204ENST00000587303 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms