RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584796.5

VAPA-208, Transcript of VAMP associated protein A, human

TSL 3

Gene VAPA, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAPA-208	ENST00000584796	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAPA-208	ENST00000584796	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAPA-208	ENST00000584796	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NPHS1	O60500	1241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	GJA9	P57773	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MMP19	Q99542	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NTM	Q9P121	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796		K7ESM1	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	FUCA1	P04066	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NTRK1	P04629	796 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	C8B	P07358	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CNR2	P34972	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	DPF3	Q92784	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	KCNH1	O95259	989 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CYP2C8	P10632	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	PLS3	P13797	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SCRN1	Q12765	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	BVES	Q8NE79	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	2e-8	■■■□□ 16.8
VAPA-208	ENST00000584796	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ITGB3	P05106	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	THBD	P07204	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	THBS2	P35442	1172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	APBA2	Q99767	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SGSM2	O43147	1006 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NAT2	P11245	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SLC6A11	P48066	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NCAPH	Q15003	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	INF2	Q27J81	1249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796		Q8N1Y9	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAPA-208	ENST00000584796	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAPA-208	ENST00000584796	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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