RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF445P59923 1031 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 C1QTNF8P60827 252 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PRR33A8MZF0 331 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PPM1BO75688 479 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 F13BP05160 661 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 MASP1P48740 699 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 EVA1CP58658 441 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRB2O60241 1585 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 NAIPQ13075 1403 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 GDF11O95390 407 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CBX7O95931 251 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 ITGA4P13612 1032 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 L1CAMP32004 1257 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CYP27A1Q02318 531 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 NFIAQ12857 509 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRM-208ENST00000578600 BVESQ8NE79 360 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 LGR4Q9BXB1 951 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 U3KQE9 123 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 TECPR2O15040 1411 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 GLI3P10071 1580 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PLSCR1O15162 318 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 TBX1O43435 398 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 RAB11FIP3O75154 756 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PPP2R2AP63151 447 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 TNK2Q07912 1038 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRM-208ENST00000578600 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 FBXL6Q8N531 539 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 NINJ1Q92982 152 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 MFSD3Q96ES6 412 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 STK26Q9P289 416 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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PTPRM-208ENST00000578600 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SIGLEC6O43699 453 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SRFP11831 508 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 CNGA1P29973 690 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 OXCT1P55809 520 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRM-208ENST00000578600 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 BRF1Q92994 677 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 AKT3Q9Y243 479 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 SHISA3A0PJX4 238 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF1O95521 474 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV1-40P01703 118 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 GRIA2P42262 883 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 FAM209AQ5JX71 171 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-208ENST00000578600 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.33□□□□□ -1.24
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