RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RTN1	Q16799	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	APBA2	Q99767	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHA2	P01877	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CYBA	P13498	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGB8	P26012	769 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPK4	P31152	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TXLNA	P40222	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RGS2	P41220	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RTP1	P59025	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT76	Q01546	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GRB14	Q14449	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SHH	Q15465	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO19	Q96H55	970 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH7	P12883	1935 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093		E9PSI1	815 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DNM1L	O00429	736 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	COBL	O75128	1261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ABL1	P00519	1130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GH2	P01242	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ASNS	P08243	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	VCAM1	P19320	739 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	EPHB4	P54760	987 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MTX1	Q13505	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	BAD	Q92934	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms