RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 KRT79Q5XKE5 535 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC7Q99615 494 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 IDI2Q9BXS1 227 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 SLX4Q8IY92 1834 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 ECE2O60344 883 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 MKL1Q969V6 931 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 DCAF4Q8WV16 495 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 HAS1Q92839 578 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 CHP1Q99653 195 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 NYAP2Q9P242 653 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.9■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP25P42331 645 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 CLCN6P51797 869 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 CENPPQ6IPU0 288 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 STYK1Q6J9G0 422 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 KCNK18Q7Z418 384 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.89■■□□□ 1.74
EHD4-202ENST00000569223 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SLFN13Q68D06 897 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 DYMQ7RTS9 669 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 RAD21O60216 631 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SLC1A4P43007 532 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 MIIPQ5JXC2 388 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.88■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 H0YIN7 160 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 FAM53CQ9NYF3 392 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA10O95299 355 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ABL1P00519 1130 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ECM1Q16610 540 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SLC35F6Q8N357 371 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 GJA10Q969M2 543 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NUP58Q9BVL2 599 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 RASSF10A6NK89 507 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L15C9J2P7 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L11C9JVI0 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L18D6R9N7 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L22D6RA61 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L19D6RCP7 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L20D6RJB6 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L24Q0WX57 530 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SEPT2Q15019 361 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 WDR59Q6PJI9 974 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.86■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 MARCH6O60337 910 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 KLK7P49862 253 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 RETREG2Q8NC44 543 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 DDX12PQ92771 950 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ICA1Q05084 483 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 EHHADHQ08426 723 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 MEA1Q16626 185 aa25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TEX35Q5T0J7 233 aa25.84■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.84■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.84■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.84■■□□□ 1.73
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