RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	GRB10	Q13322	594 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SPA17	Q15506	151 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ERICH4	A6NGS2	130 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	KIF5A	Q12840	1032 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD2	Q13200	908 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MCM6	Q14566	821 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SLC51A	Q86UW1	340 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC4	Q96A65	974 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC42	Q96M95	316 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		20.51	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SNHG28	P0DPA3	235 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	VWA3B	Q502W6	1294 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	KRT79	Q5XKE5	535 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	VAV2	P52735	878 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM260	Q9NX78	707 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		20.5	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MYMK	A6NI61	221 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT2	Q15019	361 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MAN2A1	Q16706	1144 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MAP9	Q49MG5	647 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	IQCE	Q6IPM2	695 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	NDST4	Q9H3R1	872 aa		20.49	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ENC1	O14682	589 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	KLK7	P49862	253 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	USP14	P54578	494 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	RAD54L	Q92698	747 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA5	Q96PV4	448 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	GABPA	Q06546	454 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TMC4	Q7Z404	712 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SWAP70	Q9UH65	585 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		20.48	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL1	O95922	423 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	CASP8	Q14790	479 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM58	Q8NG06	486 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	COA7	Q96BR5	231 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TSG101	Q99816	390 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559		H3BQF6	201 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SLC37A4	O43826	429 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB2	P05120	415 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	PROM2	Q8N271	834 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	POLL	Q9UGP5	575 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		20.47	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TDP2	O95551	362 aa		20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	HPS3	Q969F9	1004 aa		20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	MED4	Q9NPJ6	270 aa		20.46	■□□□□ 0.87
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf229	H3BNL8	230 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	IDE	P14735	1019 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF543	Q08ER8	600 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	CUL5	Q93034	780 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	MMS19	Q96T76	1030 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	USP21	Q9UK80	565 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	RCCD1	A6NED2	376 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	TACC1	O75410	805 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	LCA5L	O95447	670 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	TNNI2	P48788	182 aa		20.45	■□□□□ 0.86
RRN3-205	ENST00000563559	DYM	Q7RTS9	669 aa		20.45	■□□□□ 0.86

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