RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 EVI5LQ96CN4 794 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 A6NJR5 290 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 B4DLN1 442 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF28PB7ZC32 967 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNQ1P51787 676 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHMP4BP1P59074 171 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNERQ8NFT8 737 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 FGAP02671 866 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 EDNRBP24530 442 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPOPA6NHQ4 379 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF543Q08ER8 600 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 NCOR1O75376 2440 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 HAND2P61296 217 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAP1Q03518 808 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 USH1GQ495M9 461 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRT40Q6A162 431 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM227BQ96M60 508 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC14Q96N46 770 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0D9SFI3 127 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAIAP3O94812 1187 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF15O94989 841 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARIH2O95376 493 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNJ6P48051 423 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTGISQ16647 500 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 COG5Q9UP83 839 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLL1O43897 1013 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNHG28P0DPA3 235 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAGE1Q8TC20 777 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZMYM6O95789 1325 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGS22Q8NE09 1264 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 AFG1LQ8WV93 481 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM122AQ96E09 287 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 GH1P01241 217 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 MMP3P08254 477 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLA2G5P39877 138 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDE1AP54750 535 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRB10Q13322 594 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 HLA-CQ95604 372 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TET1Q8NFU7 2136 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 LY6KQ17RY6 165 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHST3Q7LGC8 479 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SESTD1Q86VW0 696 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CPVLQ9H3G5 476 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SELPP16109 830 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGAP1Q07960 439 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPRED2Q7Z698 418 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ESR2Q92731 530 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCB11O95342 1321 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 STXBP2Q15833 593 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-210ENST00000561256 DGKHQ86XP1 1220 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms