RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	MEIS2	O14770	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACLY	P53396	1101 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	EVC	P57679	992 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SNX17	Q15036	470 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	RTN1	Q16799	776 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	COPS5	Q92905	334 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PQY0	241 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	RGS20	O76081	388 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ASGR1	P07306	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NR3C2	P08235	984 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SYN1	P17600	705 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	RCAN1	P53805	252 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	RTP1	P59025	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	FGD1	P98174	961 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRAF1	Q13077	416 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PGM5	Q15124	567 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	STXBP2	Q15833	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NTRK3	Q16288	839 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112		Q9Y3F1	56 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CEP290	O15078	2479 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	NID2	Q14112	1375 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112		B4DLN1	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CDK7	P50613	346 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PKN1	Q16512	942 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	UBE2S	Q16763	222 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RASGRF1-208	ENST00000561112	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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