RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559844.5

SNX1-208, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX1, Length 1,971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-208ENST00000559844 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 IQUBQ8NA54 791 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 PRR29P0C7W0 189 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 MORC3Q14149 939 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 SPATA20Q8TB22 786 aa20.12■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.12■□□□□ 0.81
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SNX1-208ENST00000559844 INF2Q27J81 1249 aa20.11■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 PAGE5Q96GU1 130 aa20.11■□□□□ 0.81
SNX1-208ENST00000559844 ZIC5Q96T25 663 aa20.11■□□□□ 0.81
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SNX1-208ENST00000559844 PTPN18Q99952 460 aa20.08■□□□□ 0.81
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SNX1-208ENST00000559844 USP17L18D6R9N7 530 aa20.08■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 USP17L22D6RA61 530 aa20.08■□□□□ 0.8
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SNX1-208ENST00000559844 USP17L19D6RCP7 530 aa20.08■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 USP17L20D6RJB6 530 aa20.08■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 FLOT1O75955 427 aa20.08■□□□□ 0.8
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SNX1-208ENST00000559844 USP17L24Q0WX57 530 aa20.08■□□□□ 0.8
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SNX1-208ENST00000559844 BMP6P22004 513 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 SLC16A2P36021 539 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 FEM1BQ9UK73 627 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 PDHXO00330 501 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 AFMP43652 599 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 INHBEP58166 350 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 DPYDQ12882 1025 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.85e-6■□□□□ 10.8
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SNX1-208ENST00000559844 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 ZBTB5O15062 677 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 OR52Z1P0C646 297 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 GSDMDP57764 484 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 FANCCQ00597 558 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 MTMR8Q96EF0 704 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 AK8Q96MA6 479 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 IFNKQ9P0W0 207 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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SNX1-208ENST00000559844 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 IFNL1Q8IU54 200 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 KIFC2Q96AC6 838 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 COA7Q96BR5 231 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.05■□□□□ 0.8
SNX1-208ENST00000559844 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.05■□□□□ 0.8
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