RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB6A	P20340	208 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	VAMP1	P23763	118 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT6	Q14141	434 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	PICK1	Q9NRD5	415 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	DISC1	Q9NRI5	854 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	GGT7	Q9UJ14	662 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	CSAD	Q9Y600	493 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-238	ENST00000556288	AK9	Q5TCS8	1911 aa		5.84	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP10D	Q9P241	1426 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCC12	Q96J65	1359 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF521	Q96K83	1311 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	HMX2	A2RU54	273 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PLIN1	O60240	522 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PDE8A	O60658	829 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	COBL	O75128	1261 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	BCAR3	O75815	825 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV5-2	P06315	115 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	NFIC	P08651	508 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF76	P36508	570 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	NFKBIB	Q15653	356 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCY9	O60503	1353 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	BBOX1	O75936	387 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RECK	O95980	971 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PF4	P02776	101 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	LRP8	Q14114	963 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	GCKR	Q14397	625 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	INPP5A	Q14642	412 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	TTLL4	Q14679	1199 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	SOGA3	Q5TF21	947 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	HDX	Q7Z353	690 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	LINS1	Q8NG48	757 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	JDP2	Q8WYK2	163 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCC4	O15439	1325 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	FST	P19883	344 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK8	P49336	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVK-24	P63145	666 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	LMNB2	Q03252	620 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	GRAP	Q13588	217 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP7	Q14244	749 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-238	ENST00000556288	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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