RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 FAAP100Q0VG06 881 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TRAF1Q13077 416 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA0355O15063 1070 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CYTH3O43739 400 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 KIF5BP33176 963 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CDK7P50613 346 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TMTC2Q8N394 836 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 OPLAHO14841 1288 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ITGB8P26012 769 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 CPT1AP50416 773 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL4Q14679 1199 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 IWS1Q96ST2 819 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K14Q99558 947 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 MYL3P08590 195 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 HSD17B4P51659 736 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 ITGA7Q13683 1181 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 STXBP2Q15833 593 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 COPS5Q92905 334 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 PXMP2Q9NR77 195 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD1-208ENST00000555806 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 RXRAP19793 462 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 LIFRP42702 1097 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PSMC6P62333 389 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 NEK1Q96PY6 1258 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 TBX21Q9UL17 535 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.32■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 ARIH2O95376 493 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 NR3C2P08235 984 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 POLR2MP0CAP2 368 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 GNAQP50148 359 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 GHRHRQ02643 423 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 TIMP1P01033 207 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CALM1P0DP23 149 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CALM2P0DP24 149 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CALM3P0DP25 149 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 FPGSQ05932 587 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SHHQ15465 462 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.3■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 GRIN2DO15399 1336 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 LY6KQ17RY6 165 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MICU3Q86XE3 530 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 RASEFQ8IZ41 740 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.29■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 GH1P01241 217 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CD4P01730 458 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SMARCA1P28370 1054 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 KRT32Q14532 448 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.28■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 LAMA3Q16787 3333 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SZT2Q5T011 3432 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 A6NJR5 290 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 KPNA6O60684 536 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 PGM5Q15124 567 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 MFSD5Q6N075 450 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.27■■□□□ 1
NEDD1-208ENST00000555806 B4GALT4O60513 344 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD1-208ENST00000555806 CCND2P30279 289 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD1-208ENST00000555806 EPHB4P54760 987 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD1-208ENST00000555806 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD1-208ENST00000555806 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD1-208ENST00000555806 GPR153Q6NV75 609 aa21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms