RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SP8Q8IXZ3 490 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 FOSL2P15408 326 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 CES1P23141 567 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 GRK4P32298 578 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 EHD4Q9H223 541 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 USP16Q9Y5T5 823 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.93□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 REV3LO60673 3130 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ECE2O60344 883 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SETDB1Q15047 1291 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ARHGEF6Q15052 776 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ZNF790Q6PG37 636 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RELL1Q8IUW5 271 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SPACA7Q96KW9 195 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ASB2Q96Q27 587 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.92□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 KCNQ3O43525 872 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 KIF4AO95239 1232 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 FCGRTP55899 365 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 MAP3K11Q16584 847 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 CEP135Q66GS9 1140 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NFE2L2Q16236 605 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SUSD4Q5VX71 490 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 PMEPA1Q969W9 287 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SRRDQ9UH36 339 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 PPME1Q9Y570 386 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PP55 124 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 FBXO24O75426 580 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 ALX3O95076 343 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 NTSR2O95665 410 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 PRMT2P55345 433 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 PWP1Q13610 501 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 NYXQ9GZU5 481 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 POLLQ9UGP5 575 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 BBOX1O75936 387 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 NF2P35240 595 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 TCEAL1Q15170 157 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 MUC3BQ9H195 1237 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-216ENST00000537568 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms