RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 CALM1P0DP23 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 CALM2P0DP24 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 CALM3P0DP25 149 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 SPC25Q9HBM1 224 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB43O43298 467 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 BEX3Q00994 111 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 MYLIPQ8WY64 445 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 TBX21Q9UL17 535 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-218ENST00000531995 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CDC27P30260 824 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 AK2P54819 239 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GJA9P57773 515 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 FGD1P98174 961 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GNASQ5JWF2 1037 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 MICU3Q86XE3 530 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TOX2Q96NM4 488 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GBF1Q92538 1859 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CTAGE5O15320 804 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 SMARCA1P28370 1054 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 NEK4P51957 841 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 RCAN1P53805 252 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 FUT2Q10981 343 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TLK2Q86UE8 772 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 NID2Q14112 1375 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ELP1O95163 1332 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ICAM1P05362 532 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 KIF5BP33176 963 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TNFAIP2Q03169 654 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 NSMFQ6X4W1 530 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TIMP1P01033 207 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 RTN1Q16799 776 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TKFCQ3LXA3 575 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PIGSQ96S52 555 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.041e-12■□□□□ 11.1
PUF60-218ENST00000531995 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ASB14A6NK59 587 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ARVCFO00192 962 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 FOSL2P15408 326 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GNAQP50148 359 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 SMPD1P17405 629 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 DNAJB2P25686 324 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CDK7P50613 346 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 NTRK3Q16288 839 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB5O15062 677 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CSF2RAP15509 400 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PPP2R5BQ15173 497 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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