RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 PXMP2Q9NR77 195 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 REC8O95072 547 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 KRT32Q14532 448 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 FANCBQ8NB91 859 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.72■■□□□ 1.07
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TSTA3-211ENST00000529899 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 NKX3-2P78367 333 aa21.71■■□□□ 1.07
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TSTA3-211ENST00000529899 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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TSTA3-211ENST00000529899 SPC25Q9HBM1 224 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-211ENST00000529899 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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TSTA3-211ENST00000529899 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 CALM1P0DP23 149 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 CALM2P0DP24 149 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 CALM3P0DP25 149 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 ITGB8P26012 769 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 CDC27P30260 824 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 PSMC6P62333 389 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 POLR2MP0CAP2 368 aa21.69■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 PPP2R5BQ15173 497 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 LY6KQ17RY6 165 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.69■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 BRF1Q92994 677 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.69■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 SCFD2Q8WU76 684 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 PPFIA3O75145 1194 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 SMARCA1P28370 1054 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.67■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 MYL3P08590 195 aa21.66■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 FAAP100Q0VG06 881 aa21.66■■□□□ 1.06
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TSTA3-211ENST00000529899 UBE2SQ16763 222 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 IWS1Q96ST2 819 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 MAF1Q9H063 256 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 Q9Y3F1 56 aa21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 ELP1O95163 1332 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 CLTBP09497 229 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGAP1Q07960 439 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-211ENST00000529899 TTLL4Q14679 1199 aa21.65■■□□□ 1.06
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